Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC17Q9BRA2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms