Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USB1Q9BQ65 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USB1Q9BQ65 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USB1Q9BQ65 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USB1Q9BQ65 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
USB1Q9BQ65 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USB1Q9BQ65 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USB1Q9BQ65 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USB1Q9BQ65 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USB1Q9BQ65 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USB1Q9BQ65 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USB1Q9BQ65 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USB1Q9BQ65 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USB1Q9BQ65 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USB1Q9BQ65 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USB1Q9BQ65 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USB1Q9BQ65 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USB1Q9BQ65 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USB1Q9BQ65 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
USB1Q9BQ65 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USB1Q9BQ65 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USB1Q9BQ65 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USB1Q9BQ65 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USB1Q9BQ65 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USB1Q9BQ65 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms