Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms