Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP19Q99542 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms