Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCLRE1CQ96SD1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms