Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMTK3Q96Q04 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms