Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM20AQ96MK3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms