Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms