Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E2Q96LR5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms