Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CELF6Q96J87 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms