Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms