Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EAF2Q96CJ1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EAF2Q96CJ1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EAF2Q96CJ1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EAF2Q96CJ1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EAF2Q96CJ1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EAF2Q96CJ1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EAF2Q96CJ1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EAF2Q96CJ1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EAF2Q96CJ1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EAF2Q96CJ1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EAF2Q96CJ1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EAF2Q96CJ1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EAF2Q96CJ1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EAF2Q96CJ1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EAF2Q96CJ1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EAF2Q96CJ1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EAF2Q96CJ1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EAF2Q96CJ1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EAF2Q96CJ1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EAF2Q96CJ1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EAF2Q96CJ1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EAF2Q96CJ1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EAF2Q96CJ1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EAF2Q96CJ1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EAF2Q96CJ1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EAF2Q96CJ1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EAF2Q96CJ1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EAF2Q96CJ1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms