Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms