Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms