Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms