Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3AQ92664 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms