Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms