Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms