Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL3Q8ND23 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms