Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACBD4Q8NC06 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACBD4Q8NC06 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACBD4Q8NC06 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACBD4Q8NC06 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACBD4Q8NC06 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACBD4Q8NC06 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACBD4Q8NC06 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACBD4Q8NC06 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACBD4Q8NC06 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACBD4Q8NC06 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACBD4Q8NC06 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACBD4Q8NC06 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACBD4Q8NC06 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACBD4Q8NC06 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACBD4Q8NC06 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACBD4Q8NC06 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACBD4Q8NC06 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACBD4Q8NC06 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACBD4Q8NC06 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACBD4Q8NC06 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACBD4Q8NC06 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACBD4Q8NC06 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACBD4Q8NC06 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACBD4Q8NC06 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACBD4Q8NC06 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACBD4Q8NC06 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACBD4Q8NC06 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACBD4Q8NC06 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACBD4Q8NC06 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACBD4Q8NC06 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACBD4Q8NC06 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACBD4Q8NC06 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms