Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM71E2Q8N5Q1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms