Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms