Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM50Q86XT4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms