Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACAD11Q709F0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACAD11Q709F0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACAD11Q709F0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACAD11Q709F0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACAD11Q709F0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACAD11Q709F0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACAD11Q709F0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACAD11Q709F0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACAD11Q709F0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACAD11Q709F0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACAD11Q709F0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACAD11Q709F0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACAD11Q709F0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACAD11Q709F0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACAD11Q709F0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ACAD11Q709F0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACAD11Q709F0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACAD11Q709F0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACAD11Q709F0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACAD11Q709F0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACAD11Q709F0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACAD11Q709F0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ACAD11Q709F0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD11Q709F0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms