Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUM4

ARHGAP27, Rho GTPase-activating protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP27Q6ZUM4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms