Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms