Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms