Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCSAPQ6IQ19 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
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