Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG16L1Q676U5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms