Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms