Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM78BQ5VT40 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM78BQ5VT40 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM78BQ5VT40 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM78BQ5VT40 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM78BQ5VT40 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM78BQ5VT40 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM78BQ5VT40 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM78BQ5VT40 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM78BQ5VT40 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM78BQ5VT40 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM78BQ5VT40 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM78BQ5VT40 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM78BQ5VT40 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM78BQ5VT40 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM78BQ5VT40 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM78BQ5VT40 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM78BQ5VT40 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM78BQ5VT40 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM78BQ5VT40 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM78BQ5VT40 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM78BQ5VT40 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM78BQ5VT40 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM78BQ5VT40 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM78BQ5VT40 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM78BQ5VT40 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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