Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOGA3Q5TF21 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOGA3Q5TF21 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms