Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms