Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf46Q504U0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms