Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms