Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms