Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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