Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
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