Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NREPQ16612 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NREPQ16612 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NREPQ16612 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NREPQ16612 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NREPQ16612 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NREPQ16612 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NREPQ16612 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NREPQ16612 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NREPQ16612 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NREPQ16612 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NREPQ16612 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NREPQ16612 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NREPQ16612 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NREPQ16612 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NREPQ16612 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NREPQ16612 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NREPQ16612 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NREPQ16612 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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NREPQ16612 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NREPQ16612 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NREPQ16612 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NREPQ16612 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NREPQ16612 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NREPQ16612 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NREPQ16612 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NREPQ16612 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NREPQ16612 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NREPQ16612 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NREPQ16612 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NREPQ16612 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NREPQ16612 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NREPQ16612 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NREPQ16612 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NREPQ16612 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NREPQ16612 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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NREPQ16612 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NREPQ16612 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NREPQ16612 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NREPQ16612 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NREPQ16612 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NREPQ16612 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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NREPQ16612 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NREPQ16612 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NREPQ16612 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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NREPQ16612 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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NREPQ16612 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NREPQ16612 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NREPQ16612 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NREPQ16612 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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NREPQ16612 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NREPQ16612 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NREPQ16612 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NREPQ16612 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NREPQ16612 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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NREPQ16612 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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NREPQ16612 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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NREPQ16612 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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NREPQ16612 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NREPQ16612 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NREPQ16612 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NREPQ16612 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NREPQ16612 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NREPQ16612 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NREPQ16612 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NREPQ16612 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NREPQ16612 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NREPQ16612 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NREPQ16612 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NREPQ16612 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
NREPQ16612 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NREPQ16612 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NREPQ16612 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NREPQ16612 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NREPQ16612 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NREPQ16612 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NREPQ16612 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NREPQ16612 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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