Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
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