Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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