Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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SSX1Q16384 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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SSX1Q16384 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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SSX1Q16384 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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