Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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