Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 ZNF410-210ENST00000554797 537 ntTSL 23.23□□□□□ -1.897e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.97e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 EFCAB14-206ENST00000487741 784 ntTSL 33.08□□□□□ -1.927e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 GYPB-207ENST00000506679 606 ntTSL 1 (best)2.88□□□□□ -1.957e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 SECISBP2L-205ENST00000558461 310 ntTSL 32.82□□□□□ -1.967e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.977e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 GYPB-211ENST00000510196 508 ntTSL 1 (best)2.75□□□□□ -1.977e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.977e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 DNAJB14-208ENST00000471101 4799 ntTSL 22.27□□□□□ -2.057e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 DNAJB14-203ENST00000420137 3442 ntTSL 1 (best)2.06□□□□□ -2.087e-8■■■■■ 35
SF3B4Q15427 TRIM47-204ENST00000587339 1907 ntTSL 1 (best)17.3■□□□□ 0.362e-9■■■■■ 35
SF3B4Q15427 TRIM47-205ENST00000587774 720 ntTSL 217.09■□□□□ 0.332e-9■■■■■ 35
SF3B4Q15427 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.272e-9■■■■■ 35
SF3B4Q15427 TRIM47-203ENST00000586495 605 ntTSL 215.55■□□□□ 0.082e-9■■■■■ 35
SF3B4Q15427 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.047e-7■■■■■ 34.9
SF3B4Q15427 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.017e-7■■■■■ 34.9
SF3B4Q15427 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.097e-7■■■■■ 34.9
SF3B4Q15427 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.237e-7■■■■■ 34.9
SF3B4Q15427 TBRG4-217ENST00000495973 3409 ntTSL 1 (best)10.43□□□□□ -0.747e-7■■■■■ 34.9
SF3B4Q15427 MAPK12-204ENST00000467891 2019 ntTSL 528.31■■■□□ 2.125e-14■■■■■ 34.9
SF3B4Q15427 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.335e-14■■■■■ 34.9
SF3B4Q15427 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.835e-14■■■■■ 34.9
SF3B4Q15427 MAPK12-206ENST00000488504 1785 ntTSL 519.95■□□□□ 0.785e-14■■■■■ 34.9
SF3B4Q15427 MAPK12-205ENST00000482969 2101 ntTSL 216.42■□□□□ 0.225e-14■■■■■ 34.9
SF3B4Q15427 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.425e-14■■■■■ 34.9
SF3B4Q15427 ZNF782-202ENST00000430274 562 ntTSL 324.75■■□□□ 1.553e-9■■■■■ 34.9
SF3B4Q15427 ZNF782-204ENST00000478850 932 ntTSL 522.04■■□□□ 1.123e-9■■■■■ 34.9
SF3B4Q15427 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.633e-9■■■■■ 34.9
SF3B4Q15427 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.093e-9■■■■■ 34.9
SF3B4Q15427 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.153e-9■■■■■ 34.9
SF3B4Q15427 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.273e-9■■■■■ 34.9
SF3B4Q15427 ZNF782-203ENST00000466833 628 ntTSL 310.94□□□□□ -0.663e-9■■■■■ 34.9
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SF3B4Q15427 ZNF782-201ENST00000289032 2355 ntTSL 25.96□□□□□ -1.463e-9■■■■■ 34.9
SF3B4Q15427 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.573e-9■■■■■ 34.9
SF3B4Q15427 PWWP2A-203ENST00000520662 407 ntTSL 34.99□□□□□ -1.613e-9■■■■■ 34.9
SF3B4Q15427 MED24-228ENST00000581058 524 ntTSL 47.76□□□□□ -1.175e-7■■■■■ 34.9
SF3B4Q15427 MBD1-213ENST00000586118 1012 ntTSL 315.88■□□□□ 0.137e-7■■■■■ 34.9
SF3B4Q15427 ARRB1-203ENST00000524400 593 ntTSL 412.53□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 34.9
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SF3B4Q15427 AC023509.1-201ENST00000547717 1571 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.854e-7■■■■■ 34.9
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SF3B4Q15427 SH3GLB2-208ENST00000455407 837 ntTSL 226.07■■□□□ 1.763e-6■■■■■ 34.9
SF3B4Q15427 SH3GLB2-212ENST00000483980 1015 ntTSL 226.07■■□□□ 1.763e-6■■■■■ 34.9
SF3B4Q15427 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.593e-6■■■■■ 34.9
SF3B4Q15427 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.953e-6■■■■■ 34.9
SF3B4Q15427 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 34.9
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SF3B4Q15427 SH3GLB2-209ENST00000461811 4828 ntTSL 1 (best)12.72□□□□□ -0.373e-6■■■■■ 34.9
SF3B4Q15427 SH3GLB2-206ENST00000417224 1468 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.563e-6■■■■■ 34.9
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SF3B4Q15427 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 34.9
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SF3B4Q15427 HPS1-205ENST00000414009 857 ntTSL 213.38□□□□□ -0.279e-8■■■■■ 34.9
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SF3B4Q15427 AUP1-204ENST00000463900 1645 ntTSL 1 (best)15.79■□□□□ 0.123e-8■■■■■ 34.8
SF3B4Q15427 AUP1-202ENST00000425118 1581 ntTSL 1 (best)15.29■□□□□ 0.043e-8■■■■■ 34.8
SF3B4Q15427 AUP1-206ENST00000466894 1658 ntTSL 514.66□□□□□ -0.063e-8■■■■■ 34.8
SF3B4Q15427 RBM39-237ENST00000492779 2316 ntTSL 26.37□□□□□ -1.394e-7■■■■■ 34.8
SF3B4Q15427 CTSA-209ENST00000493522 901 ntTSL 210.43□□□□□ -0.742e-6■■■■■ 34.8
SF3B4Q15427 CTSA-205ENST00000419493 606 ntTSL 28.82□□□□□ -12e-6■■■■■ 34.8
SF3B4Q15427 POFUT2-206ENST00000463917 441 ntTSL 312.69□□□□□ -0.383e-10■■■■■ 34.8
SF3B4Q15427 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 34.8
SF3B4Q15427 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 34.8
SF3B4Q15427 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 34.8
SF3B4Q15427 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 34.8
SF3B4Q15427 CCAR1-203ENST00000479143 478 ntTSL 54.15□□□□□ -1.751e-15■■■■■ 34.8
SF3B4Q15427 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.851e-6■■■■■ 34.8
SF3B4Q15427 AFDN-218ENST00000507704 1031 ntTSL 312.3□□□□□ -0.441e-25■■■■■ 34.8
SF3B4Q15427 CDC42BPG-203ENST00000480767 454 ntTSL 314.54□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 34.8
SF3B4Q15427 JAG1-203ENST00000488480 1161 ntTSL 412.57□□□□□ -0.42e-13■■■■■ 34.8
SF3B4Q15427 NKTR-215ENST00000487466 2335 ntTSL 214.21□□□□□ -0.136e-12■■■■■ 34.8
SF3B4Q15427 CERCAM-209ENST00000483737 481 ntTSL 213.78□□□□□ -0.24e-8■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 SLC16A1-204ENST00000458229 2201 ntTSL 216.3■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 SLC16A1-202ENST00000429288 865 ntTSL 310.59□□□□□ -0.712e-7■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 SLC16A1-203ENST00000443580 1099 ntTSL 39□□□□□ -0.972e-7■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 SLC16A1-206ENST00000481750 430 ntTSL 25.98□□□□□ -1.452e-7■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 PDXDC1-201ENST00000325823 1113 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.352e-9■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 TTLL3-232ENST00000496526 5282 ntTSL 210.53□□□□□ -0.722e-11■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 TTLL3-211ENST00000430390 1674 ntTSL 1 (best)10.5□□□□□ -0.732e-11■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 TTLL3-201ENST00000310252 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)10.31□□□□□ -0.762e-11■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 TTLL3-228ENST00000483051 4176 ntTSL 59.03□□□□□ -0.962e-11■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 PRPF8-213ENST00000576407 566 ntTSL 27.63□□□□□ -1.194e-11■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 CDKN1C-205ENST00000471157 944 ntTSL 222.42■■□□□ 1.182e-7■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.622e-7■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.612e-7■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.192e-7■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 KMT5C-209ENST00000587442 464 ntTSL 310.2□□□□□ -0.781e-8■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 DENND5A-209ENST00000529977 2606 ntTSL 29.4□□□□□ -0.98e-8■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 AMPD2-207ENST00000467071 556 ntTSL 211.03□□□□□ -0.643e-18■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 SREBF1-216ENST00000490796 698 ntTSL 218.1■□□□□ 0.491e-9■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 EDC4-211ENST00000575514 1016 ntTSL 516.1■□□□□ 0.172e-9■■■■■ 34.7
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