Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR6A1Q15406 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR6A1Q15406 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR6A1Q15406 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR6A1Q15406 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR6A1Q15406 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NR6A1Q15406 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR6A1Q15406 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR6A1Q15406 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR6A1Q15406 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR6A1Q15406 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR6A1Q15406 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR6A1Q15406 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NR6A1Q15406 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR6A1Q15406 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR6A1Q15406 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR6A1Q15406 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR6A1Q15406 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR6A1Q15406 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms