Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.488e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.478e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 STARD3-223ENST00000583582 1350 ntTSL 217.66■□□□□ 0.428e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 CALM1-206ENST00000553630 1420 ntTSL 517.59■□□□□ 0.411e-7■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 LMNB2-205ENST00000532465 769 ntTSL 317.48■□□□□ 0.394e-7■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 NAGPA-214ENST00000568528 543 nt17.44■□□□□ 0.388e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.338e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.338e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 STARD3-216ENST00000579479 560 ntTSL 416.94■□□□□ 0.38e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 STARD3-210ENST00000577248 571 ntTSL 416.94■□□□□ 0.38e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.288e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 STARD3-212ENST00000578254 562 ntTSL 516.54■□□□□ 0.248e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.28e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 STARD3-218ENST00000580551 554 ntTSL 216.32■□□□□ 0.28e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 NAGPA-215ENST00000569296 866 ntTSL 516.09■□□□□ 0.178e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 NDUFAF6-218ENST00000523378 949 ntTSL 316.09■□□□□ 0.178e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 STARD3-203ENST00000443521 673 ntTSL 516.03■□□□□ 0.168e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 CALM1-213ENST00000556757 588 ntTSL 215.98■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 CALM1-210ENST00000555132 554 ntTSL 415.98■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 CALM1-208ENST00000553995 583 ntTSL 215.98■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 CALM1-215ENST00000557123 569 ntTSL 315.98■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 SSBP4-204ENST00000597724 865 ntTSL 515.82■□□□□ 0.128e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 STARD3-207ENST00000484773 916 ntTSL 315.73■□□□□ 0.118e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 NAGPA-212ENST00000567739 583 ntTSL 215.65■□□□□ 0.18e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.078e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.078e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.068e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 STARD3-221ENST00000582874 591 ntTSL 315.42■□□□□ 0.068e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 STARD3-204ENST00000460894 584 ntTSL 515.42■□□□□ 0.068e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 STARD3-228ENST00000585214 566 ntTSL 415.38■□□□□ 0.058e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.048e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 CHD7-204ENST00000526846 500 ntTSL 215.2■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.018e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 DISC1-210ENST00000468399 1871 ntTSL 214.92□□□□□ -0.028e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 SSBP4-211ENST00000601614 628 ntTSL 214.81□□□□□ -0.048e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 STARD3-222ENST00000583419 579 ntTSL 414.76□□□□□ -0.058e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 NDUFAF6-208ENST00000519136 816 ntTSL 514.71□□□□□ -0.058e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.068e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 STARD3-225ENST00000583718 550 ntTSL 414.66□□□□□ -0.068e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 STARD3-208ENST00000488876 2404 ntTSL 214.41□□□□□ -0.18e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 STARD3-211ENST00000578232 851 ntTSL 214.36□□□□□ -0.118e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.138e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 MAP2K2-211ENST00000602167 431 ntTSL 514.21□□□□□ -0.138e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 LMNB2-203ENST00000490554 689 ntTSL 214.17□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.158e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.188e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 SSBP4-214ENST00000607020 504 ntTSL 313.8□□□□□ -0.28e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 STARD3-220ENST00000581894 591 ntTSL 313.79□□□□□ -0.28e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 NAGPA-210ENST00000565876 544 ntTSL 413.3□□□□□ -0.288e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.348e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.358e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 PCSK7-215ENST00000540028 3332 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.398e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 BORCS8-204ENST00000488252 3149 ntTSL 212.59□□□□□ -0.398e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 ENO1-201ENST00000234590 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.418e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.448e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 CALM1-214ENST00000557020 557 ntTSL 412.21□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 INAVA-201ENST00000367342 4298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.468e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.468e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 PLD5-202ENST00000366545 2729 ntTSL 212.14□□□□□ -0.478e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 CALM1-201ENST00000356978 4242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 ERCC2-208ENST00000586737 481 ntTSL 512.03□□□□□ -0.488e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 NDUFAF6-202ENST00000396113 2549 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.498e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 PCSK7-204ENST00000527037 2346 ntTSL 311.79□□□□□ -0.528e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 NAGPA-208ENST00000564397 3286 ntTSL 211.77□□□□□ -0.538e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 STARD3-217ENST00000580331 558 ntTSL 411.72□□□□□ -0.538e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 ENO1-206ENST00000497492 647 ntTSL 211.65□□□□□ -0.548e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 HIGD1A-205ENST00000470543 983 ntTSL 211.63□□□□□ -0.558e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 ERCC2-207ENST00000586441 682 ntTSL 511.62□□□□□ -0.558e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.578e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 CAMSAP1-201ENST00000312405 6054 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.598e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 CASK-209ENST00000468986 507 ntTSL 211.33□□□□□ -0.68e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 BORCS8-209ENST00000591566 3698 nt10.87□□□□□ -0.678e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 PCSK7-214ENST00000534529 5393 ntTSL 510.65□□□□□ -0.78e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 PLD5-208ENST00000536534 8721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.728e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 MAP2K2-205ENST00000597008 866 ntTSL 210.37□□□□□ -0.758e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 SSBP4-215ENST00000625926 162 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.798e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 BORCS8-205ENST00000494489 877 ntTSL 310.04□□□□□ -0.88e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 KIF18B-202ENST00000587309 4217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.88e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 PLD5-205ENST00000459864 490 ntTSL 29.99□□□□□ -0.818e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 TCAF1-204ENST00000478172 576 ntTSL 49.72□□□□□ -0.858e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 GAK-212ENST00000510022 618 ntTSL 49.69□□□□□ -0.868e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 MAP2K2-206ENST00000597263 552 ntTSL 39.44□□□□□ -0.98e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 CASK-208ENST00000442742 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.938e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 BORCS8-207ENST00000588208 457 ntTSL 38.85□□□□□ -0.998e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 SORCS2-204ENST00000511199 532 ntTSL 48.73□□□□□ -1.018e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 TCAF1-201ENST00000355951 3343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.018e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 PCSK7-207ENST00000528973 9347 ntTSL 38.55□□□□□ -1.048e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 TTL-202ENST00000460450 4148 ntTSL 28.42□□□□□ -1.068e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 CASK-204ENST00000378166 3123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.098e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 MAP2K2-207ENST00000599021 314 ntTSL 58.04□□□□□ -1.128e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 GSAP-202ENST00000334003 2277 ntTSL 28□□□□□ -1.138e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 PLD5-201ENST00000314833 2830 ntTSL 27.89□□□□□ -1.158e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 ENO1-205ENST00000492343 826 ntTSL 1 (best)7.74□□□□□ -1.178e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 PCSK7-213ENST00000533135 549 ntTSL 57.57□□□□□ -1.28e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 CASK-212ENST00000477823 640 ntTSL 37.13□□□□□ -1.278e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.368e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 STAG1-204ENST00000462818 1227 ntTSL 36.01□□□□□ -1.458e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 ENO1-203ENST00000486051 536 ntTSL 35.88□□□□□ -1.478e-8■■■■■ 32.6
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 480.9 ms