Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHD4Q14839 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms