Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
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DDX39BQ13838 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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DDX39BQ13838 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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DDX39BQ13838 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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DDX39BQ13838 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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DDX39BQ13838 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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DDX39BQ13838 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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DDX39BQ13838 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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