Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HTR4Q13639 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms