Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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